劇場版5作目。ポケモンマスターを目指して旅を続けるサトシ（松本梨香）とピカチュウ（大谷育江）、カスミ（飯塚雅弓）、タケシ（上田祐司）は水の都アルトマーレにやって来た。そこでサトシはザンナー（神田うの）とリオン（釈由美子）の怪盗姉妹に襲われて…

フランクリン教授（チャーリー・オコンネル）と妻のアン（カーメン・エレクトラ）はケイト（ブルック・ホーガン）ら生徒10数人とともにクルーザーで太平洋へ課外授業に出かけるが、サメの死骸にぶつかり船が破損して航行不能になってしまう。船を修理する間…

ゴジラとムートーの戦いから5年後。秘密機関「モナーク」のエマ・ラッセル博士（ヴェラ・ファーミガ）は孵化したモスラの幼虫との交信に成功するが、アラン・ジョナ（チャールズ・ダンス）率いる環境テロリストの一味に襲撃される。エマは娘のマディソン（ミ…